Το μέσο πυρήνα ενός φίλτρου συγχώνευσης είναι συνήθως εξαιρετικά-λεπτές μικροΐνες γυαλιού ή ίνες πολυεστέρα που έχουν υποστεί ειδική χημική επεξεργασία. Αυτό το υλικό πρέπει να έχει εξαιρετική υδροφιλικότητα (για αφαίρεση νερού) ή ελαιοφιλικότητα (για αφαίρεση λαδιού) έτσι ώστε τα μικροσκοπικά σταγονίδια να μπορούν γρήγορα να προσκολληθούν και να συνενωθούν. Επιπλέον, τα μέσα πρέπει να έχουν επαρκή δομική αντοχή για να αντέχουν την υψηλή διαφορική πίεση και την κρούση του υγρού κατά τη διαδικασία φιλτραρίσματος.
